Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms