Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APCDD1LQ8NCL9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APCDD1LQ8NCL9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APCDD1LQ8NCL9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APCDD1LQ8NCL9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APCDD1LQ8NCL9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APCDD1LQ8NCL9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APCDD1LQ8NCL9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APCDD1LQ8NCL9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APCDD1LQ8NCL9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APCDD1LQ8NCL9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms