Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms