Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL3Q8N8U3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL3Q8N8U3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL3Q8N8U3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL3Q8N8U3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL3Q8N8U3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL3Q8N8U3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL3Q8N8U3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL3Q8N8U3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL3Q8N8U3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL3Q8N8U3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL3Q8N8U3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL3Q8N8U3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL3Q8N8U3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL3Q8N8U3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL3Q8N8U3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL3Q8N8U3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL3Q8N8U3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL3Q8N8U3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms