Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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