Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms