Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJD3Q8N144 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms