Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms