Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms