Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms