Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms