Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms