Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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