Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms