Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms