Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UFSP1Q6NVU6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms