Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms