Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms