Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP350Q5VT06 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms