Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PXDC1Q5TGL8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms