Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHYHD1Q5SRE7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms