Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms