Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms