Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms