Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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