Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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