Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CTF1Q16619 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CTF1Q16619 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CTF1Q16619 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CTF1Q16619 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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