Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SGCAQ16586 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SGCAQ16586 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SGCAQ16586 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SGCAQ16586 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SGCAQ16586 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SGCAQ16586 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SGCAQ16586 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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