Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYPL1Q16563 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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