Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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