Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CNGA3Q16281 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CNGA3Q16281 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CNGA3Q16281 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CNGA3Q16281 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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