Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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