Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms