Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
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