Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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