Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms