Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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