Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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