Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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