Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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