Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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GINS1Q14691 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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GINS1Q14691 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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GINS1Q14691 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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GINS1Q14691 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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GINS1Q14691 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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GINS1Q14691 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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GINS1Q14691 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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GINS1Q14691 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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