Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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