Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms