Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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