Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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