Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms