Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms