Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms