Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME3Q13232 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME3Q13232 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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