Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms